Protein–RNA interactions for Protein: Q69YZ2

TMEM200B, Transmembrane protein 200B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200BQ69YZ2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
TMEM200BQ69YZ2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.83■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
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TMEM200BQ69YZ2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TMEM200BQ69YZ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
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TMEM200BQ69YZ2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TMEM200BQ69YZ2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
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