Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
INTS3Q68E01 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
INTS3Q68E01 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
INTS3Q68E01 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
INTS3Q68E01 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.6 ms