Protein–RNA interactions for Protein: Q5XKE5

KRT79, Keratin, type II cytoskeletal 79, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT79Q5XKE5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
KRT79Q5XKE5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT79Q5XKE5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT79Q5XKE5 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
KRT79Q5XKE5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms