Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TSGA10IPQ3SY00 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
TSGA10IPQ3SY00 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TSGA10IPQ3SY00 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
TSGA10IPQ3SY00 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms