Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNCBQ16143 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNCBQ16143 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SNCBQ16143 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SNCBQ16143 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
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