Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

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Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ZNF56Q15929 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
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ZNF56Q15929 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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ZNF56Q15929 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
ZNF56Q15929 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
ZNF56Q15929 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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