Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH18Q13634 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH18Q13634 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH18Q13634 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CDH18Q13634 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
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