Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 PILRB-201ENST00000419749 1506 ntTSL 1 (best)17.36■□□□□ 0.378e-10■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 PILRB-210ENST00000457519 2074 ntTSL 1 (best)16.55■□□□□ 0.248e-10■■■■■ 27.8
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ILF3Q12906 PILRB-209ENST00000455145 902 ntTSL 514.13□□□□□ -0.158e-10■■■■■ 27.8
ILF3Q12906 PILRB-203ENST00000431140 772 ntTSL 313.72□□□□□ -0.218e-10■■■■■ 27.8
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ILF3Q12906 PILRB-211ENST00000493091 4345 ntTSL 212.66□□□□□ -0.388e-10■■■■■ 27.8
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ILF3Q12906 MCPH1-AS1-204ENST00000527490 543 ntTSL 313.65□□□□□ -0.221e-9■■■■■ 27.8
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ILF3Q12906 CAPN15-202ENST00000562370 942 ntTSL 226.51■■□□□ 1.832e-15■■■■■ 27.7
ILF3Q12906 CAPN15-208ENST00000637507 1482 ntTSL 521.86■■□□□ 1.092e-15■■■■■ 27.7
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ILF3Q12906 FN1-204ENST00000356005 7846 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.596e-9■■■■■ 27.7
ILF3Q12906 FN1-211ENST00000443816 7762 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.616e-9■■■■■ 27.7
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ILF3Q12906 FN1-209ENST00000432072 7759 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.86e-9■■■■■ 27.7
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ILF3Q12906 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-8■■■■■ 27.6
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ILF3Q12906 TMEM131L-201ENST00000240487 4299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)6.94□□□□□ -1.32e-8■■■■■ 27.6
ILF3Q12906 EIF3E-215ENST00000522445 841 ntTSL 35.53□□□□□ -1.522e-8■■■■■ 27.6
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ILF3Q12906 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.524e-7■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.751e-9■■■■■ 27.4
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ILF3Q12906 FNIP1-203ENST00000510461 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.931e-9■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.571e-9■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.581e-9■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.61e-9■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 ATP2A2-209ENST00000550248 544 ntTSL 47.2□□□□□ -1.268e-8■■■■■ 27.4
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ILF3Q12906 SSR1-210ENST00000489567 1893 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.176e-8■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.236e-8■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 SSR1-206ENST00000479365 1118 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.266e-8■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.676e-8■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 SSR1-207ENST00000479485 640 ntTSL 24.25□□□□□ -1.736e-8■■■■■ 27.4
ILF3Q12906 ATXN2L-226ENST00000570284 701 ntTSL 515.45■□□□□ 0.061e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-211ENST00000563314 4574 ntTSL 514.17□□□□□ -0.141e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)13.63□□□□□ -0.231e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.291e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.411e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.431e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.471e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 ATXN2L-203ENST00000340394 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.541e-11■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 UTP4-211ENST00000567460 595 ntTSL 422.89■■□□□ 1.256e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.96e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.86e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 HPN-207ENST00000599363 1828 ntTSL 519.9■□□□□ 0.786e-8■■■■■ 27.3
ILF3Q12906 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.736e-8■■■■■ 27.3
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