Protein–RNA interactions for Protein: Q12277

RRP42, Exosome complex component RRP42, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 265 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRP42Q12277 TSA1YML028W 591 nt5.91□□□□□ -1.46
RRP42Q12277 snR82snR82 268 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP42Q12277 QRI5YLR204W 336 nt5.9□□□□□ -1.46
RRP42Q12277 WHI2YOR043W 1461 nt5.9□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YDR387CYDR387C 1668 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 ICS3YJL077C 396 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 MRPS16YPL013C 366 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 UTP4YDR324C 2331 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 RAP1YNL216W 2484 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 GPB2YAL056W 2643 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 ATG22YCL038C 1587 nt5.89□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YDR034W-BYDR034W-B 156 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YDR278CYDR278C 318 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 HST3YOR025W 1344 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 KNS1YLL019C 2214 nt5.88□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 CDC34YDR054C 888 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YEL068CYEL068C 333 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 GUD1YDL238C 1470 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 PXL1YKR090W 2121 nt5.87□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 GPI11YDR302W 660 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 RPT3YDR394W 1287 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 DOT5YIL010W 648 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 PRE3YJL001W 648 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 CCP1YKR066C 1086 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 HAP3YBL021C 435 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 RPS28AYOR167C 204 nt5.86□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 RIO1YOR119C 1455 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 FZF1YGL254W 900 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 SPG1YGR236C 288 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 MOG1YJR074W 657 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 RPS5YJR123W 678 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 GCV3YAL044C 513 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YHM2YMR241W 945 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 JNM1YMR294W 1122 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 VHT1YGR065C 1782 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 MDM31YHR194W 1740 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 PYC2YBR218C 3543 nt5.85□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YUR1YJL139C 1287 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 MRPS12YNR036C 462 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 YPR114WYPR114W 948 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 PET112YBL080C 1626 nt5.84□□□□□ -1.47
RRP42Q12277 ALT2YDR111C 1524 nt5.84□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 CIT3YPR001W 1461 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 IVY1YDR229W 1362 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 LDB19YOR322C 2457 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 TEP1YNL128W 1305 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YDL129WYDL129W 876 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 BUD32YGR262C 786 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 DAP1YPL170W 459 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 GLN1YPR035W 1113 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 IFA38YBR159W 1044 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 SKS1YPL026C 1509 nt5.83□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 HIS7YBR248C 1659 nt5.82□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 KKQ8YKL168C 2175 nt5.82□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt5.82□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 ISC1YER019W 1434 nt5.82□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YFR006WYFR006W 1608 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 CSC1YLR241W 2349 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 PGK1YCR012W 1251 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 ZRT2YLR130C 1269 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 ARA2YMR041C 1008 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YOL163WYOL163W 510 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 HXT17YNR072W 1695 nt5.81□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 KTR5YNL029C 1569 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 CIN4YMR138W 576 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 GFA1YKL104C 2154 nt5.8□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 EHD3YDR036C 1503 nt5.79□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 ATG4YNL223W 1485 nt5.79□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YPR123CYPR123C 435 nt5.79□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 RAD24YER173W 1980 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 MAK32YCR019W 1092 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 SHO1YER118C 1104 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 MRS1YIR021W 1092 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 ATP4YPL078C 735 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 PDR18YNR070W 4002 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 MNN5YJL186W 1761 nt5.78□□□□□ -1.48
RRP42Q12277 YHL017WYHL017W 1599 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 ATF1YOR377W 1578 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 MCM3YEL032W 2916 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 LEU5YHR002W 1074 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 ENV7YPL236C 1095 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 FRS2YFL022C 1512 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 PYK2YOR347C 1521 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 TPO3YPR156C 1869 nt5.77□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 TIF2YJL138C 1188 nt5.76□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 TIF1YKR059W 1188 nt5.76□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YML083CYML083C 1257 nt5.76□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 YBR226CYBR226C 411 nt5.76□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 PRI2YKL045W 1587 nt5.76□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 RGD1YBR260C 2001 nt5.75□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 ADE12YNL220W 1302 nt5.75□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 PHB1YGR132C 864 nt5.75□□□□□ -1.49
RRP42Q12277 ICT1YLR099C 1185 nt5.75□□□□□ -1.49
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