Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PRDX1Q06830 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRDX1Q06830 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PRDX1Q06830 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms