Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KCNC4Q03721 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCNC4Q03721 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
KCNC4Q03721 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KCNC4Q03721 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms