Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
EFNB1P98172 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNB1P98172 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNB1P98172 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms