Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SIM1P81133 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIM1P81133 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SIM1P81133 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIM1P81133 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIM1P81133 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIM1P81133 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SIM1P81133 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SIM1P81133 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIM1P81133 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIM1P81133 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SIM1P81133 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SIM1P81133 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIM1P81133 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIM1P81133 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIM1P81133 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIM1P81133 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIM1P81133 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SIM1P81133 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SIM1P81133 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIM1P81133 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIM1P81133 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIM1P81133 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIM1P81133 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIM1P81133 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SIM1P81133 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIM1P81133 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIM1P81133 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SIM1P81133 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SIM1P81133 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIM1P81133 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIM1P81133 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIM1P81133 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIM1P81133 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIM1P81133 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SIM1P81133 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIM1P81133 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SIM1P81133 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIM1P81133 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIM1P81133 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIM1P81133 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SIM1P81133 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIM1P81133 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIM1P81133 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIM1P81133 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIM1P81133 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SIM1P81133 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIM1P81133 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIM1P81133 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SIM1P81133 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIM1P81133 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SIM1P81133 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIM1P81133 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIM1P81133 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIM1P81133 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIM1P81133 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIM1P81133 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIM1P81133 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIM1P81133 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SIM1P81133 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIM1P81133 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIM1P81133 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SIM1P81133 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SIM1P81133 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms