Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GTF2IP78347 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
GTF2IP78347 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GTF2IP78347 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF2IP78347 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GTF2IP78347 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GTF2IP78347 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms