Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CSNK2BP67870 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CSNK2BP67870 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms