Protein–RNA interactions for Protein: P51677

CCR3, C-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR3P51677 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR3P51677 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCR3P51677 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR3P51677 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR3P51677 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR3P51677 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR3P51677 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR3P51677 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR3P51677 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR3P51677 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR3P51677 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR3P51677 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR3P51677 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR3P51677 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR3P51677 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR3P51677 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR3P51677 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR3P51677 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR3P51677 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR3P51677 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR3P51677 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR3P51677 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR3P51677 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR3P51677 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR3P51677 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR3P51677 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCR3P51677 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR3P51677 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR3P51677 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR3P51677 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR3P51677 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR3P51677 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR3P51677 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR3P51677 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR3P51677 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR3P51677 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR3P51677 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR3P51677 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR3P51677 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR3P51677 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR3P51677 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR3P51677 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR3P51677 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR3P51677 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR3P51677 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCR3P51677 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR3P51677 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR3P51677 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR3P51677 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCR3P51677 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR3P51677 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR3P51677 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR3P51677 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR3P51677 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCR3P51677 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR3P51677 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR3P51677 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR3P51677 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR3P51677 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCR3P51677 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms