Protein–RNA interactions for Protein: P48730

CSNK1D, Casein kinase I isoform delta, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1DP48730 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CSNK1DP48730 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CSNK1DP48730 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CSNK1DP48730 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 359.9 ms