Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.96■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.96■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC38.95■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC38.95■■■■□ 3.83
RANGAP1P46060 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC38.94■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC38.94■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.93■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC38.92■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC38.91■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC38.9■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC38.9■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC38.89■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC38.89■■■■□ 3.82
RANGAP1P46060 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC38.88■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC38.88■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC38.87■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC38.86■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC38.83■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.81
RANGAP1P46060 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC38.82■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC38.81■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.79■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
RANGAP1P46060 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC38.71■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.7■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
RANGAP1P46060 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC38.69■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC38.68■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC38.67■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC38.66■■■■□ 3.78
RANGAP1P46060 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.8 ms