Protein–RNA interactions for Protein: P32881

IFNA8, Interferon alpha-8, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA8P32881 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IFNA8P32881 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
IFNA8P32881 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
IFNA8P32881 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.4 ms