Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASQ1P31415 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASQ1P31415 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASQ1P31415 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASQ1P31415 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.3 ms