Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA6P31267 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HOXA6P31267 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
HOXA6P31267 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HOXA6P31267 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191.3 ms