Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
VAMP1P23763 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VAMP1P23763 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
VAMP1P23763 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms