Protein–RNA interactions for Protein: P22303

ACHE, Acetylcholinesterase, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACHEP22303 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACHEP22303 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ACHEP22303 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACHEP22303 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACHEP22303 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ACHEP22303 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ACHEP22303 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACHEP22303 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACHEP22303 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACHEP22303 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACHEP22303 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ACHEP22303 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACHEP22303 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACHEP22303 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ACHEP22303 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACHEP22303 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACHEP22303 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ACHEP22303 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACHEP22303 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACHEP22303 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACHEP22303 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACHEP22303 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACHEP22303 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACHEP22303 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACHEP22303 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ACHEP22303 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ACHEP22303 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACHEP22303 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACHEP22303 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACHEP22303 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ACHEP22303 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACHEP22303 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ACHEP22303 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ACHEP22303 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ACHEP22303 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ACHEP22303 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ACHEP22303 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACHEP22303 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACHEP22303 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACHEP22303 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ACHEP22303 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACHEP22303 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ACHEP22303 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACHEP22303 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ACHEP22303 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ACHEP22303 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ACHEP22303 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ACHEP22303 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACHEP22303 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACHEP22303 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ACHEP22303 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.3 ms