Protein–RNA interactions for Protein: P22090

RPS4Y1, 40S ribosomal protein S4, Y isoform 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS4Y1P22090 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS4Y1P22090 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS4Y1P22090 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS4Y1P22090 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms