Protein–RNA interactions for Protein: P17544

ATF7, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7P17544 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF7P17544 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF7P17544 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF7P17544 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATF7P17544 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATF7P17544 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF7P17544 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF7P17544 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF7P17544 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF7P17544 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF7P17544 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF7P17544 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATF7P17544 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATF7P17544 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATF7P17544 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATF7P17544 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATF7P17544 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF7P17544 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF7P17544 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF7P17544 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF7P17544 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF7P17544 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATF7P17544 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATF7P17544 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATF7P17544 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATF7P17544 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATF7P17544 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATF7P17544 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATF7P17544 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATF7P17544 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATF7P17544 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF7P17544 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF7P17544 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF7P17544 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF7P17544 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATF7P17544 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF7P17544 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF7P17544 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF7P17544 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF7P17544 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF7P17544 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATF7P17544 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATF7P17544 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATF7P17544 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF7P17544 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF7P17544 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF7P17544 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF7P17544 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATF7P17544 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF7P17544 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF7P17544 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF7P17544 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF7P17544 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATF7P17544 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATF7P17544 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms