Protein–RNA interactions for Protein: P16220

CREB1, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB1P16220 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB1P16220 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB1P16220 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CREB1P16220 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB1P16220 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB1P16220 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB1P16220 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB1P16220 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CREB1P16220 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CREB1P16220 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CREB1P16220 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CREB1P16220 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CREB1P16220 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB1P16220 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB1P16220 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB1P16220 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB1P16220 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CREB1P16220 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CREB1P16220 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB1P16220 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB1P16220 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB1P16220 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB1P16220 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CREB1P16220 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
CREB1P16220 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB1P16220 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24■■□□□ 1.43
CREB1P16220 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB1P16220 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CREB1P16220 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CREB1P16220 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CREB1P16220 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CREB1P16220 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms