Protein–RNA interactions for Protein: P0DP25

CALM3, Calmodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM3P0DP25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CALM3P0DP25 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CALM3P0DP25 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CALM3P0DP25 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CALM3P0DP25 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79 ms