Protein–RNA interactions for Protein: P0CW24

PNMA6A, Paraneoplastic antigen-like protein 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA6AP0CW24 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PNMA6AP0CW24 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PNMA6AP0CW24 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PNMA6AP0CW24 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms