Protein–RNA interactions for Protein: P04040

CAT, Catalase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATP04040 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATP04040 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATP04040 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CATP04040 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATP04040 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATP04040 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATP04040 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATP04040 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CATP04040 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATP04040 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CATP04040 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CATP04040 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CATP04040 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATP04040 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATP04040 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATP04040 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATP04040 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CATP04040 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CATP04040 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CATP04040 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATP04040 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATP04040 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATP04040 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CATP04040 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATP04040 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATP04040 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CATP04040 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATP04040 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATP04040 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATP04040 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CATP04040 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATP04040 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CATP04040 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CATP04040 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CATP04040 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CATP04040 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CATP04040 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATP04040 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATP04040 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATP04040 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CATP04040 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CATP04040 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CATP04040 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CATP04040 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CATP04040 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CATP04040 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CATP04040 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms