Protein–RNA interactions for Protein: P01588

EPO, Erythropoietin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOP01588 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPOP01588 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOP01588 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOP01588 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOP01588 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOP01588 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOP01588 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPOP01588 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EPOP01588 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EPOP01588 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPOP01588 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPOP01588 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPOP01588 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EPOP01588 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EPOP01588 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EPOP01588 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EPOP01588 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPOP01588 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPOP01588 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPOP01588 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPOP01588 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EPOP01588 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EPOP01588 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPOP01588 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
EPOP01588 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPOP01588 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
EPOP01588 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
EPOP01588 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
EPOP01588 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPOP01588 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPOP01588 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPOP01588 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPOP01588 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPOP01588 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EPOP01588 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPOP01588 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPOP01588 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPOP01588 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EPOP01588 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPOP01588 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPOP01588 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPOP01588 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPOP01588 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
EPOP01588 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPOP01588 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPOP01588 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPOP01588 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPOP01588 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EPOP01588 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPOP01588 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPOP01588 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPOP01588 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EPOP01588 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPOP01588 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPOP01588 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EPOP01588 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPOP01588 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPOP01588 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPOP01588 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPOP01588 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EPOP01588 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms