Protein–RNA interactions for Protein: O60235

TMPRSS11D, Transmembrane protease serine 11D, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS11DO60235 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMPRSS11DO60235 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMPRSS11DO60235 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMPRSS11DO60235 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms