Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENRO43583 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENRO43583 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
DENRO43583 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENRO43583 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENRO43583 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENRO43583 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENRO43583 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENRO43583 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
DENRO43583 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
DENRO43583 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
DENRO43583 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENRO43583 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENRO43583 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENRO43583 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENRO43583 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENRO43583 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
DENRO43583 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENRO43583 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENRO43583 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENRO43583 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENRO43583 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
DENRO43583 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
DENRO43583 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
DENRO43583 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
DENRO43583 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENRO43583 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENRO43583 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENRO43583 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENRO43583 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
DENRO43583 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENRO43583 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
DENRO43583 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
DENRO43583 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENRO43583 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENRO43583 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DENRO43583 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
DENRO43583 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENRO43583 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENRO43583 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENRO43583 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENRO43583 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DENRO43583 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DENRO43583 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms