Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC8O43402 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC8O43402 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EMC8O43402 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC8O43402 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC8O43402 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC8O43402 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC8O43402 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EMC8O43402 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC8O43402 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC8O43402 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC8O43402 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC8O43402 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC8O43402 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EMC8O43402 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EMC8O43402 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EMC8O43402 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC8O43402 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC8O43402 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC8O43402 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC8O43402 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
EMC8O43402 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC8O43402 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC8O43402 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC8O43402 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC8O43402 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC8O43402 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EMC8O43402 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC8O43402 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC8O43402 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC8O43402 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC8O43402 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC8O43402 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EMC8O43402 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EMC8O43402 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EMC8O43402 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EMC8O43402 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
EMC8O43402 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC8O43402 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC8O43402 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC8O43402 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC8O43402 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EMC8O43402 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC8O43402 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC8O43402 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC8O43402 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EMC8O43402 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC8O43402 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC8O43402 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC8O43402 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC8O43402 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC8O43402 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EMC8O43402 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms