Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXA3O43365 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
HOXA3O43365 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
HOXA3O43365 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms