Protein–RNA interactions for Protein: O15399

GRIN2D, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2D, humanhuman

Predictions only

Length 1,336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2DO15399 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GRIN2DO15399 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GRIN2DO15399 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
GRIN2DO15399 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GRIN2DO15399 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms