Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
IFIT3O14879 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
IFIT3O14879 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IFIT3O14879 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
IFIT3O14879 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 147.8 ms