Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
J3QRE1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3QRE1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3QRE1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRE1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRE1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRE1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRE1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3QRE1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3QRE1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3QRE1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRE1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRE1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRE1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRE1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
J3QRE1 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
J3QRE1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
J3QRE1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
J3QRE1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
J3QRE1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
J3QRE1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRE1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRE1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
J3QRE1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
J3QRE1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
J3QRE1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms