Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 385 ms