Protein–RNA interactions for Protein: C9JSJ3

BHMG1, Basic helix-loop-helix and HMG box domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMG1C9JSJ3 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
BHMG1C9JSJ3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BHMG1C9JSJ3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
BHMG1C9JSJ3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BHMG1C9JSJ3 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms