Protein–RNA interactions for Protein: A6NM43

CCT8L1P, Putative T-complex protein 1 subunit theta-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8L1PA6NM43 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CCT8L1PA6NM43 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CCT8L1PA6NM43 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCT8L1PA6NM43 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8L1PA6NM43 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8L1PA6NM43 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCT8L1PA6NM43 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8L1PA6NM43 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8L1PA6NM43 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCT8L1PA6NM43 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms