Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GOLGA6L9A6NEM1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GOLGA6L9A6NEM1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
GOLGA6L9A6NEM1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GOLGA6L9A6NEM1 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms