Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ1

PILRA, Paired immunoglobulin-like type 2 receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PILRAQ9UKJ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PILRAQ9UKJ1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PILRAQ9UKJ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PILRAQ9UKJ1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms