Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GTF2IRD1Q9UHL9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GTF2IRD1Q9UHL9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GTF2IRD1Q9UHL9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GTF2IRD1Q9UHL9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms