Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHD7Q9P2D1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHD7Q9P2D1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CHD7Q9P2D1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms