Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
TMOD3Q9NYL9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
TMOD3Q9NYL9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.64
TMOD3Q9NYL9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.51■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TMOD3Q9NYL9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
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