Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX57

RAB20, Ras-related protein Rab-20, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB20Q9NX57 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAB20Q9NX57 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RAB20Q9NX57 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RAB20Q9NX57 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RAB20Q9NX57 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms