Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWZ3

IRAK4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRAK4Q9NWZ3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
IRAK4Q9NWZ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRAK4Q9NWZ3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
IRAK4Q9NWZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms