Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWY4

HPF1, Histone PARylation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPF1Q9NWY4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HPF1Q9NWY4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HPF1Q9NWY4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HPF1Q9NWY4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HPF1Q9NWY4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms