Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUG4

CCM2L, Cerebral cavernous malformations 2 protein-like, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2LQ9NUG4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCM2LQ9NUG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCM2LQ9NUG4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCM2LQ9NUG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms