Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PRDM9Q9NQV7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRDM9Q9NQV7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRDM9Q9NQV7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRDM9Q9NQV7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms